El CTNS desenvolupa projectes de recerca propis que busquen noves eines per a produir i demostrar les propietats saludables dels aliments funcionals.
L'èxit de l'aliment funcional, deixant de banda els aspectes purament de màrqueting, està condicionat per la seva eficàcia biològica i pel coneixement del mecanisme biològic a través del qual s'exerceix aquesta funcionalitat per a la prevenció de factors de risc de les patologies de més incidència social.
El CTNS està desenvolupant diverses línies de recerca per a generar resultats de consens, que aportin prou solidesa i seguretat a l'entorn empresarial i confiança al consumidor. Actualment les principals línies de recerca que desenvolupa el CTNS són:
